一、技术概述
DNA pull down-MS是体外研究DNA与蛋白互作的有力工具。该技术将生物素标记的DN**段结合在链霉亲和素磁珠上，再与细胞核蛋白孵育，纯化出与DN**段互作的蛋白，洗涤洗脱得到的蛋白产物，做western-blot检测特定蛋白是否与靶DN**段结合；做质谱鉴定即可筛选出与DN**段可能互作的蛋白信息（如具体某个或某些转录因子/组蛋白等）。
二、技术原理
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用；其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下，与已知的几乎所有生物大分子偶联。因此用生物素标记核酸后，利用生物素和链霉亲和素之间的亲和作用，可以纯化出各种生物大分子复合物。
DNA pull down实验首先针对靶标区域设计DNA探针，探针经过脱硫生物素标记，跟偶联在磁珠上的链霉亲和素结合；细胞核提取物与磁珠-DNA探针孵育，纯化出与靶DN**段结合的蛋白复合体，洗脱得到DN**段的结合蛋白质。
三、技术应用
目的DN**段的互作蛋白（如转录因子等）筛选。
四、技术流程
体外合成生物素标记的DN**段→提取核蛋白→孵育→洗涤、洗脱互作蛋白→质谱鉴定。
五、服务信息：
| 项目名称 | 客户提供 | 结果交付 |
| DNA pull down |
1. 基因信息（物种、序列） 2. 细胞系及培养信息 3. 待验证的蛋白信息 4. 蛋白抗体 |
1. 原始结果图（包括Input、阳性及阴性对照结果） 2. 完整实验报告（包括实验材料、方法、结果分析） |
| DNA pull down MS |
1. 基因信息（物种、序列或ID） 2. 细胞系及培养信息 |
1. 原始结果图（input和洗脱液的SDS-PAGE图） 2. 质谱检索结果 3. 完整实验报告（包括实验材料、方法、结果分析） |
六、参考文献
1.A requirement for breast-cancer-associated gene 1 (BRCA1) in the spindle checkpoint. Proc Natl AcadSci U S A 101(49):17108-17113(2004).
2.Identification of DNA-binding proteins that interact with the 5'-flanking region of the human D-amino acid oxidase gene by pull-down assay coupled with two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry. J Pharm Biomed Anal 116:94-100(2015).