在癌组织中，与野生型DNA序列的高含量相比，体细胞突变往往只是微乎其微的量。在这样一个大量野生型等位基因存在的背景下检测这些稀有突变是相当具有挑战性的。
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胰岛素抵抗基因表达PCR芯片包括胰岛素和脂联素信号通路相关的脂肪基因、通常在NIDDM中失调的基因、先天免疫和炎症过程有关的基因，以及碳水化合物和脂质代谢过程中重要的酶和转运蛋白相关基因。
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Polycomb & Trithorax复合物靶基因基因表达PCR芯片可以同时检测被Polycomb &Trithorax复合物调控的84个关键基因的表达。
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高血压基因表达PCR芯片可以用于检测分析与高血压关联的器官和组织，包括：心脏、肾脏、肝脏、肺，以及含有毛细血管和平滑肌的活检组织。
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药物代谢基因表达PCR芯片上的基因编码的酶对药物运输（如金属硫和P-糖蛋白），I 期新陈代谢（特别是P450家族），II期代谢（如转移酶和水解酶）有重要作用。
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酶联免疫吸附试验的标准程序，通常是把蛋白、抗体等（即抗原）直接或是以捕捉抗体（capture Ab）固定在固相载体上，再加入一级检测抗体（primarydetection Ab），形成一个抗原抗
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Notch信号靶标基因表达PCR芯片包含了Notch经典信号通路的转录因子和研究验证得到的高关联性靶标基因，通过该芯片得到的结果可用于Notch信号传导激活和抑制研究。
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癌症通路发现者基因表达PCR芯片可用于研究在肿瘤发生和转移过程中，该芯片包含了9个与癌症相关的重要信号通路的基因，通过实时定量PCR的方法，研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测肿瘤发生和转移过程中标志基因的表达，研究各种肿瘤细胞通路的活性状况。
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