微生物群落是生活在动物体内的微生物的集合，其中许多微生物对健康至关重要。先前的研究表明，微生物缺乏某些类型细菌的小鼠更有可能患糖尿病。也有一些证据表明某些微生物可以预防糖尿病。
许多科学家在老鼠身上做微生物群落实验，在它们进行干预之前，用抗生素清除细菌，我们发现这种清除对老鼠的新陈代谢有巨大的影响。所以一些新陈代谢的影响可以归因于消耗而不是干预。
研究人员并没有专门研究抗生素引起的能量消耗是如何影响葡萄糖水平的。他们想要观察当微生物群落耗尽时，小鼠新陈代谢的昼夜节律(24小时)。这种类型的研究通常是在无菌环境下饲养的老鼠身上进行的。
因为我们无法接触到这些无菌小鼠，所以我们决定使用临床常用的抗生素来耗尽微生物群落。研究人员在老鼠身上使用了四种不同抗生素的混合物。这种弱点——没有合适的老鼠——变成了一种力量，使我们能够做出这一意想不到的发现。
在对小鼠进行治疗后，研究人员观察到，与预期一样，小鼠肠道中存在的微生物多样性大幅减少。当他们观察老鼠的新陈代谢时，他们发现他们能够比预期更快地清除血液中的葡萄糖。
进一步的研究表明，小鼠的结肠组织是葡萄糖吸收额外糖分的一种载体，从而降低血液中糖分的含量。这种行为符合观察结果，老鼠的结肠有明显的增大。
研究人员随后发现，这些代谢变化实际上与肝功能的变化以及肝脏释放的胆汁酸有关。这些老鼠的体脂成分和它们的身体成分没有变化——这两种物质通常影响葡萄糖代谢，已知这两种物质在人类2型糖尿病中起作用。